北京市疾病预防控制中心是根据国家卫生防病机构改革精神，在北京市卫生防疫站、北京市劳动卫生与职业病防治研究所、北京市健康教育所、北京市性病防治所的基础上，于2000年6月正式组建成立的市级卫生事业单位。承担全市传染病、慢性非传染病疾病预防与控制，学生常见病防治，消毒及病媒生物防制，食品、化妆品、涉水产品、一次性卫生用品等与百姓健康密切相关的生活用品的卫生学检测评价及卫生毒理学测试，劳动卫生和职业病防治，射线防护，从业人员健康体检、建设项目预防性卫生学评价等预防医学领域各项工作以及国内外重大活动的公共卫生保障工作。目前，中心已成为北京市疾病预防控制、检测检验、预防医学科研与教学、卫生技术培训、卫生宣传、健康教育等综合性专业机构。